Folding@Home

Fra Team Norway Wiki

Gå til: navigasjon, søk


Folding@Home
Bilde:FAH.gif
KlientEgen
KategoriBioMed
DC-VaultListe
Prosjektwebfolding.stanford.edu/English/Main
Prosjektstatsstats.free-dc.org/stats.php?page=proj&proj=fah
Forumforum.team-norway.org/tnforum/mvnforum/listthreads?forum=61
Kompatibilitet
 WindowsLinuxMac IntelMac PPCFreeBSD
32-bit X X X X  
64-bit X X X    
ATI X        
NVidia X        
Cell   X      


Innhold

Om Folding@home

Dette prosjektet studerer proteinfolding, altså den strukturelle endringen proteinet gjennomgår for å kunne utføre spesielle oppgaver i kroppen. Hvert enkelt protein gjennomgår en utvikling der proteinet får en struktur avhengig av den funksjon det skal ha. Det finnes mange forskjellige spesialiserte protein i mennesket. Et eksempl på dette er spesielle morkake-protein som blir antatt å fungere som “klokker” under et svangerskap, og drive nedtelling frem mot en vellykket fødsel. Et annet eksempel er de mange enzymene som driver nedbryting av maten vi spiser.

Men prosjektet har ikke som eneste målsetning å studere vellykkede proteinstrukturer. De er også interessert i å finne ut av hva som går galt når proteinet ikke utvikler seg som det skal. I dag antas flere sykdommer som blant annet alzheimers, parkinsons, kugalskap og noen typer kreft å være et resultat av feilslåtte proteinstrukturer.

De mer langsiktige målene med disse studiene er å kunne forstå proteinets utvikling for så å kunne lage egne spesialiserte protein med medisinsk virkning. Man kan da både erstatte mislykkede protein i kroppen og tilføre nye protein med bestemte oppgaver. Denne muligheten har av mange blitt karakterisert som en ny verden innen medisinsk forskning. Et annet mål er å kartlegge eventuelle faktorer som påvirker den endelige proteinstrukturen for å kunne øke graden av suksess i foldefasen.

Prosjektet drives av en forskingsgruppe på Stanford universistet under ledelse av Vijay Pande. Prosjektet står i en særstilling blant de andre distribuerte databehandlingsprosjekt hva angår oppfølging av medlemmene, dokumentasjon av arbeidet og prosessen, artikkelproduksjon og oppmerksomhet i det medisinske forskningsmiljøet.

Bli medlem på Folding@Home-prosjektet

Ny på dette prosjektet?

Gå til programndelasting-siden. Bruk søkefunksjonen på denne siden til å se om brukernavnet du ønsker å bruke ikke er tatt i bruk.

Gå tilbake og last ned versjonen som passer deg.

Under installasjon av programmet, vil du bli spurt om navn. Her skriver du brukernavnet du ønsker å bruke i prosjektet. Til slutt popper "Folding @ Home Control Panel" opp, under Team number skriver du inn 37827 .

Bytt lag til Team Norway

For å bytte lag må du endre teamnummeret i konfigurasjons-panelet til 37827 som er Team-Norway sitt nummer-id.

Tips & Triks

Nvidia GPU-klient på Linux

Hvis du har et Nvidia skjermkort kan du kjøre Folding på Linux med å bruke denne oppskriften -> installasjonsguide. I korte trekk bruker man Wine, en Windows-emulator for Linux, for å kjøre GPU-klienten. ATI-kort kan for tiden ikke kjøres på Linux.

Istedet for å bruke den gamle nvidia-versjonen (180.xx) så anbefaler vi å bruke cuda 3.0 som du finner i nvidia-versjon 195.xx. Denne er raskere.

Dei som har nvidia-195.xx eller nyere, og wine ferdig innstallert, kan hoppe over punktene 1-5, halve punkt 6 og hele punkt 7 og 8 i installeringsguiden.

I punkt 6 må du laste ned CUDA_Toolkit, og du bruker den som står der - NVIDIA_CUDA_Toolkit_2.0_ubuntu7.10_x86, den gjør jobben helt fint. Fra punkt 9 og utover følger du guiden slik den står.

Linux-GPU fungerer med nvidia versjonene 180.xx og 195.xx, men ikke 185.xx eller 190.xx.

Merk at GPU på Linux ikke er støttet offisielt, så man er i større grad overlatt til seg selv hvis noe ikke virker.

Personlige verktøy